Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RabggtbP53612 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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