Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DbtP53395 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DbtP53395 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DbtP53395 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DbtP53395 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbtP53395 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbtP53395 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbtP53395 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DbtP53395 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms