Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Defa6P50704 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Defa6P50704 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Defa6P50704 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms