Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc13P50207 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms