Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CitP49025 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CitP49025 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CitP49025 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CitP49025 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CitP49025 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CitP49025 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms