Protein–RNA interactions for Protein: P48543

Kcnj9, G protein-activated inward rectifier potassium channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj9P48543 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnj9P48543 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms