Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Prox1P48437 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prox1P48437 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms