Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcd1P48410 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcd1P48410 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms