Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx2P48379 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx2P48379 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms