Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SrprbP47758 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SrprbP47758 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SrprbP47758 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms