Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ItgavP43406 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms