Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VhlP40338 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VhlP40338 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VhlP40338 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms