Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik2P39087 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms