Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig1P37913 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms