Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin1P35438 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Grin1P35438 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms