Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptk2P34152 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptk2P34152 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms