Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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