Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctnnd1P30999 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctnnd1P30999 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms