Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msr1P30204 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms