Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcam1P29533 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcam1P29533 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms