Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtgfP29268 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtgfP29268 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms