Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa2P28309 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms