Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CftrP26361 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CftrP26361 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CftrP26361 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CftrP26361 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CftrP26361 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CftrP26361 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CftrP26361 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CftrP26361 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms