Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk11bP24788 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms