Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxd12P23812 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms