Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZfaP23607 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZfaP23607 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms