Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ms4a2P20490 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms