Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pou5f1P20263 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pou5f1P20263 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms