Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NefhP19246 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NefhP19246 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NefhP19246 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NefhP19246 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms