Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifrd1P19182 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms