Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpraP18052 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms