Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd44P15379 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd44P15379 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms