Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Irf1P15314 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf1P15314 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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