Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lmnb1P14733 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lmnb1P14733 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms