Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb2P13373 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms