Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntn1P12960 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntn1P12960 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntn1P12960 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntn1P12960 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn1P12960 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn1P12960 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms