Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Parp1P11103 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms