Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CatspereP0DP43 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CatspereP0DP43 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms