Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Amd1P0DMN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Amd1P0DMN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms