Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrbP05622 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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