Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mtnd1P03888 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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