Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P01661 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P01661 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P01661 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P01661 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms