Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnpda1O88958 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms