Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd160O88875 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cd160O88875 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms