Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Best1O88870 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Best1O88870 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Best1O88870 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Best1O88870 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms