Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dll3O88516 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms