Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vti1bO88384 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vti1bO88384 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vti1bO88384 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vti1bO88384 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vti1bO88384 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms