Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mid1O70583 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms