Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtssO70370 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtssO70370 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtssO70370 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtssO70370 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms