Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms